Chức năng, nhiệm vụ: Trung tâm quản lý khai thác các công trình thủy sản Khánh Hòa là đơn vị sự nghiệp có thu, thực hiện chế độ tài chính theo Nghị định 43/2006/ NĐ-CP ngày 25/04/2006 của Chính phủ, được UBND tỉnh cho thực hiện chế độ tự chủ một phần tài chính, lao động.

- Nhiệm vụ của Trung tâm :

+ Quản lý và khai thác có hiệu quả hệ thống các Công trình thủy sản bao gồm: Cảng cá, chợ cá, luồng lạch, mặt nước gắn liền với Cảng cá và các công trình thủy sản khác được UBND tỉnh giao quản lý.

+Định kỳ tổ chức duy tu, bảo dưỡng, nâng cấp các công trình được giao quản lý theo đúng quy định của Nhà nước.

+Lập kế hoạch bổ sung và phát triển các Công trình Thủy sản nhằm đáp ứng yêu cầu phát triển kinh tế xã hội của địa phương.

+ Tổ chức dịch vụ hậu cần nghề cá.

+ Quản lý, vận hành Vùng sản xuất và kiểm định tôm giống Ninh Vân theo Quyết định số 3532/QĐ-UBND ngày 16/11/2018 của UBND tỉnh Khánh Hòa