Ngay từ khi Viện được thành lập đã quy định rõ chức năng, nhiệm vụ là nơi bảo tồn, nghiên cứu và đào tạo đội ngũ chuyên gia Hán Nôm. Tiếp đến Quyết định số 274/QĐ-KHXH ngày 27 tháng 02 năm 2013, Viện Nghiên cứu Hán Nôm có chức năng cơ bản là nơi tổ chức nghiên cứu, khai thác và biên dịch, xuất bản di sản Hán Nôm của dân tộc, đào tạo cán bộ nghiên cứu Hán Nôm, sưu tầm, bảo quản, phục chế, nhân bản, góp phần phát triển văn hóa của dân tộc.
